Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM167BQ9NRX6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM167BQ9NRX6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms