Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BATF3Q9NR55 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms