Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX0

PRDM6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM6Q9NQX0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM6Q9NQX0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM6Q9NQX0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM6Q9NQX0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM6Q9NQX0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms