Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC177Q9NQR7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC177Q9NQR7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms