Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARS2Q9NP81 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms