Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GOPCQ9HD26 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOPCQ9HD26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOPCQ9HD26 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms