Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1BQ9H816 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms