Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPHQ9H3R5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPHQ9H3R5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPHQ9H3R5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPHQ9H3R5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPHQ9H3R5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPHQ9H3R5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPHQ9H3R5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms