Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIL1Q9H173 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIL1Q9H173 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SIL1Q9H173 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIL1Q9H173 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIL1Q9H173 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms