Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM39BQ9GZU3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM39BQ9GZU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms