Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF4Q9BZC1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.8 ms