Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF649Q9BS31 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms