Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00167Q96N53 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00167Q96N53 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1200.8 ms