Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM227BQ96M60 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms