Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PGBD1Q96JS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PGBD1Q96JS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms