Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO6Q96DC7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO6Q96DC7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO6Q96DC7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms