Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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FAM3DQ96BQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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FAM3DQ96BQ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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FAM3DQ96BQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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FAM3DQ96BQ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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FAM3DQ96BQ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3DQ96BQ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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