Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3KBP1Q96B97 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms