Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LRRC59Q96AG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LRRC59Q96AG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC59Q96AG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC59Q96AG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC59Q96AG4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC59Q96AG4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms