Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSC1Q92574 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC1Q92574 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms