Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY21

SORCS1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, humanhuman

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1Q8WY21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SORCS1Q8WY21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SORCS1Q8WY21 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS1Q8WY21 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms