Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM239Q8WW34 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM239Q8WW34 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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