Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWIST2Q8WVJ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWIST2Q8WVJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms