Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF555Q8NEP9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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