Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDF8

PAPD5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD5Q8NDF8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPD5Q8NDF8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPD5Q8NDF8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAPD5Q8NDF8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPD5Q8NDF8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPD5Q8NDF8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.1 ms