Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRPF38AQ8NAV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF38AQ8NAV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF38AQ8NAV1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms