Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms