Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf29Q8N999 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf29Q8N999 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf29Q8N999 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms