Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP2LQ8IYA6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP2LQ8IYA6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP2LQ8IYA6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms