Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS3Q8IXF0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPAS3Q8IXF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS3Q8IXF0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.1 ms