Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC83Q8IWF9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC83Q8IWF9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC83Q8IWF9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms