Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KSR1Q8IVT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KSR1Q8IVT5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KSR1Q8IVT5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KSR1Q8IVT5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KSR1Q8IVT5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KSR1Q8IVT5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KSR1Q8IVT5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KSR1Q8IVT5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KSR1Q8IVT5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KSR1Q8IVT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms