Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCXQ7RTU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms