Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00336Q6ZUF6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00336Q6ZUF6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms