Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC62Q6P9F0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC62Q6P9F0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC62Q6P9F0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms