Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND1BQ6P3S1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms