Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL13AP3Q6NVV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL13AP3Q6NVV1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL13AP3Q6NVV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL13AP3Q6NVV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL13AP3Q6NVV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL13AP3Q6NVV1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL13AP3Q6NVV1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms