Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RSBN1Q5VWQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSBN1Q5VWQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms