Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C12orf60Q5U649 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C12orf60Q5U649 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms