Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC122Q5T0U0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms