Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms