Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRRC2BQ5JSZ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms