Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT12Q53H54 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms