Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO4Q2I0M5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO4Q2I0M5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPO4Q2I0M5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms