Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SWI5Q1ZZU3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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