Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL24A1Q17RW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COL24A1Q17RW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COL24A1Q17RW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
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