Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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EXT1Q16394 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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EXT1Q16394 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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EXT1Q16394 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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EXT1Q16394 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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EXT1Q16394 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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EXT1Q16394 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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EXT1Q16394 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXT1Q16394 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXT1Q16394 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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