Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HNF4GQ14541 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HNF4GQ14541 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HNF4GQ14541 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HNF4GQ14541 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HNF4GQ14541 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HNF4GQ14541 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HNF4GQ14541 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HNF4GQ14541 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HNF4GQ14541 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms