Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SQLEQ14534 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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