Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUNX3Q13761 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX3Q13761 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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